1 材料和方法
1.1 收集数据
1.2 差异表达的miRNA
1.3 预测DEmiRNAs的靶基因
1.4 靶基因富集分析
1.5 蛋白互作网络与模型的构建
2 结果
2.1 DEmiRNAs的分析结果
2.2 制作miRNA-靶基因调控网络
2.3 GO各项与KEGG通路的富集分析
2.4 PPI构建与核心基因的筛选
3 讨论
3.1 DEmiRNAs分析
3.2 靶基因分析
3.3 OP与AD的关系
文章摘要:目的利用生物信息学分析骨质疏松症与阿尔茨海默症差异表达的miRNA及两病的相互关系。方法利用GEO数据库获取骨质疏松症(osteoporosis,OP)与阿尔茨海默症(Alzheimer’s disease,AD)的基因芯片,使用GEO2R在线分析得到OP与AD差异表达的微小核糖核酸(differentially expressed microRNA,DEmiRNA),将筛选后的DEmiRNAs用miRDB数据库和Targetscan数据库进行靶基因预测;用DAVID数据库对靶基因进行GO分析和KEGG信号通路分析,并结合STRING数据库,制作蛋白互作网络和DEmiRNAs-mRNA调控网络。结果 OP与AD的基因芯片中共有9个有意义的DEmiRNAs,通过蛋白互作网络筛选出前10个核心基因为:COL1A1、VEGFA、COL4A1、COL3A1、COL5A1、COL2A1、LOX、COL7A1、IGF1、COL5A2,同时发现hsa-miR-29b-3p和胶原蛋白在两病中的关系最为密切。结论通过研究两种疾病DEmiRNAs与核心基因有助于了解OP与AD的相互关系,了解两病共同的发病机理,为两病治疗提供新的思路与方向。
文章关键词:
项目基金:《信息记录材料》 网址: http://www.xxjlcl.cn/qikandaodu/2021/1113/2321.html
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